Эволюционная линия, приведшая к возникновению голотурий, ответвилась, по мнению Бэзера, от древних Pelmatozoa еще до полного развития радиальной симметрии (о чем свидетельствует наличие у голотурий только одной гонады). Кроме того, предполагается, что голотурии испытали частичную «регрессивную эволюцию» от Пентактеи обратно к Диплевруле — они рано вернулись к ползающему образу жизни, преоральная лопасть (стебелек) у них редуцировалась, а рот вместе с гидроцелем снова приблизился к переднему концу (см. рис. 82, Г). Но голотурии отличаются от Диплеврулы наличием амбулакральной системы, спирально изогнутой кишкой и некоторыми другими деталями строения (эволюция необратима). Бэзер подчеркивает, что стадия пентактулы, через которую проходят современные голотурии, не есть повторение филогенетической стадии Пентактеи, которую он представлял себе на основании более полных эмбриологических и палеонтологических данных не так, как Земон.
Хотя Бэзер обрисовал в общих чертах довольно правдоподобную картину эволюции иглокожих, отдельные детали этой картины остаются неясными и спорными. Примером такого рода может служить вопрос о происхождении амбулакральной системы. Если она возникла на основе пищевых бороздок, то связь левого гидроцеля с ротовым отверстием на гораздо более ранней стадии филогенеза (во время миграции рта к заднему концу только что прикрепившейся Диплеврулы) нуждается в дополнительном объяснении. Чтобы объяснить асимметричное развитие целомов, Бэзер (как и многие другие авторы — см. Grobben, 1923) предположил, что предки иглокожих прикрепились правой стороной, однако никакого подтверждения со стороны эмбриологии это не получает. Причины возникновения асимметрии у иглокожих составляют один из наиболее трудных вопросов филогении — если бы перемещение рта в апикальном направлении проходило в сагиттальной плоскости, переход от билатеральной симметрии к радиальной мог произойти без промежуточной асимметричной стадии, не говоря уже о том, что и радиальная симметрия вовсе не является обязательным атрибутом сидячего образа жизни — многие сидячие животные (мшанки, асцидии и др.) сохранили свою билатеральную симметрию. Поэтому некоторые авторы делают даже такие малоубедительные допущения, как «идиосинкразия» иглокожих к билатеральной симметрии (Mac Bride, 1914) или наличие в их организации особой склонности к асимметрии, сходной с таковой брюхоногих моллюсков (Grobben, 1923). По мнению Ньюмена (Newman 1925), причиной асимметричного развития иглокожих является более интенсивный метаболизм на левой стороне тела. Таким образом, все названные авторы считают склонность к асимметрии изначальным свойством иглокожих, но ничего не говорят о происхождении этой склонности.Заслуживают специального рассмотрения и филогенетические представления Гейдера (Heider, 1912), который различал четыре стадии метаморфоза и экстраполировал их на филогенез. I стадия филогенеза — Диплеврула, уже описанная выше, отличалась правильной билатеральной симметрией (рис. 84, А, Б). II стадию метаморфоза (и филогенеза) Гей-дер обозначает как стадию асимметрии (рис. 84, В, Г).
На этой стадии рот мигрирует на левую сторону и как бы вдавливается в левый гидроцель, который принимает подковообразную форму. Вместе с ртом на левый бок смещаются обе руки лофофора, но при этом правый гидроцель редуцируется, и щупальца правой руки лофофора вступают в сообщение с левым гидроцелем. Возможные причины этих изменений Гейдер не раскрывает, упоминая лишь вскользь, что жизнь в трубке способствует развитию асимметрии (что звучит не очень убедительно). Левый соматоцель принимает полулунную форму, как бы стремясь окружить пищевод, такие же изменения происходят в правом соматоцеле, что-и завершается образованием вертикального мезентерия. Одновременно анальное отверстие смещается по брюшной стороне вперед, и кишечник образует петлю.